1. Salmonella sp. Kelompok 1&24
| Kerajaan: | |
| Filum: | |
| Kelas: | Gamma Proteobakteria |
| Ordo: | |
| Famili: | |
| Genus: | Salmonella Lignieres 1900 |
Spesies: salmonella sp
Salmonella adalah suatu genus bakterienterobakteria gram-negatif berbentuk tongkat yang menyebabkan tifoid, paratifod, dan penyakit foodborne. Spesies-spesies Salmonella dapat bergerak bebas dan menghasilkan hidrogen sulfida. Salmonella dinamai dari Daniel Edward Salmon, ahli patologi Amerika, walaupun sebenarnya, rekannya Theobald Smith (yang terkenal akan hasilnya pada anafilaksis) yang pertama kali menemukan bakterium tahun 1885 pada tubuh babi.
Media tumbuh
Untuk menumbuhkan Salmonella dapat digunakan berbagai macam media, salah satunya adalah media Hektoen Enteric Agar (HEA). Media lain yang dapat digunakan adalah SS agar, bismuth sulfite agar, brilliant green agar, dan xylose-lisine-deoxycholate (XLD) agar. HEA merupakan media selektif-diferensial. Media ini tergolong selektif karena terdiri dari bile salt yang berguna untuk menghambat pertumbuhan bakteri gram positif dan beberapa gram negatif, sehingga diharapkan bakteri yang tumbuh hanya Salmonella. Media ini digolongkan menjadi mediadiferensial karena dapat membedakan bakteri Salmonella dengan bakteri lainnya dengan cara memberikan tiga jenis karbohidrat pada media, yaitu laktosa, glukosa, dan salisin, dengan komposisi laktosa yang paling tinggi. Salmonella tidak dapat memfermentasi laktosa, sehingga asam yang dihasilkan hanya sedikit karena hanya berasal dari fermentasi glukosa saja. Hal ini menyebabkan koloni Salmonella akan berwarna hijau-kebiruan karena asam yang dihasilkannya bereaksi dengan indikator yang ada pada media HEA, yaitu fuksin asam dan bromtimol blue.
2. Alcaligenes sp kelompok 2
| Kingdom: | Bacteria |
| Phylum: | Proteobacteria |
| Class: | Beta Proteobacteria |
| Order: | Burkholderiales |
| Family: | Alcaligenaceae |
| Genus: | Alcaligenes Spesies : Alcaligenes sp |
Alcaligenes adalah genus dari Gram-negatif, patogen, bakteri oportunistik.Alcaligenes xylosoxidans telah ditemukan di saluran pernapasan pasien cystic fibrosis. Karena spesies dari genus ini sering salah diidentifikasi, masalah terkait dengan fibrosis kistik sulit untuk belajar dan memperbaiki. Isolat dari genus ini telah ditemukan di tanah atau air. Alcaligenes faecalis sangat penting karena mengubahbentuk yang paling beracun arsenik, arsenite (AsO2-, bilangan oksidasi +3) untuk membentuk yang kurang berbahaya, arsenat (AsO4-, bilangan oksidasi +5).
Struktur genom
Alcaligenes menjadi perhatian signifikan terhadap industri medis, dan pemetaangenom akan menyediakan peneliti dengan identifikasi bakteri ini yang konsisten.Namun, tidak ada organisasi besar telah berusaha untuk urutan sebagai yang belum.
Struktur sel dan Metabolisme
3. Alcaligenes faecalis kelompok 4
Spesies Alcaligenes menghasilkan energi dalam sejumlah cara, termasuk oksidasiarsenite. Banyak tentang organisme ini hampir tidak dikenal, dan bahkanmengidentifikasi spesies yang benar menyajikan tantangan. Hal ini penting karena beberapa spesies Alcaligenes adalah penyebab potensial dari penyakit paru kronis pada pasien dengan fibrosis kistik. Alcaligenes adalah gram negatif, atauproteobacteria, yang berarti bahwa mereka memiliki amplop sel yang khas. Untuk mempelajari lebih lanjut tentang struktur sel proteobacteria, klik di sini.
Struktur genom
Alcaligenes menjadi perhatian signifikan terhadap industri medis, dan pemetaangenom akan menyediakan peneliti dengan identifikasi bakteri ini yang konsisten.Namun, tidak ada organisasi besar telah berusaha untuk urutan sebagai yang belum.
Struktur sel dan Metabolisme
3. Alcaligenes faecalis kelompok 4
Spesies Alcaligenes menghasilkan energi dalam sejumlah cara, termasuk oksidasiarsenite. Banyak tentang organisme ini hampir tidak dikenal, dan bahkanmengidentifikasi spesies yang benar menyajikan tantangan. Hal ini penting karena beberapa spesies Alcaligenes adalah penyebab potensial dari penyakit paru kronis pada pasien dengan fibrosis kistik. Alcaligenes adalah gram negatif, atauproteobacteria, yang berarti bahwa mereka memiliki amplop sel yang khas. Untuk mempelajari lebih lanjut tentang struktur sel proteobacteria, klik di sini.
ekologi
Alcaligenes ditemukan di berbagai lokasi, termasuk lingkungan tanah dan air, di mana satu spesies, Alcaligenes denitrificans, telah dikenal untuk menghambatpertumbuhan beberapa jenis ganggang. Mereka juga dapat ditemukan di saluranpernapasan pasien fibrosis kistik, dimana mereka menyebabkan gejala klinis penyakit paru.
Alcaligenes ditemukan di berbagai lokasi, termasuk lingkungan tanah dan air, di mana satu spesies, Alcaligenes denitrificans, telah dikenal untuk menghambatpertumbuhan beberapa jenis ganggang. Mereka juga dapat ditemukan di saluranpernapasan pasien fibrosis kistik, dimana mereka menyebabkan gejala klinis penyakit paru.
4. Salmonella typhi kelompok 3
Struktur Genom
Genom untuk Salmonella typhi telah sepenuhnya diurutkan. Ada sekitar 204 pseudogen dikodekan dalam Salmonella typhi. Sebagian besar gen ini telah dilemahkan oleh kodon stop, yang menunjukkan bahwa gen baru-baru ini dimodifikasi karena perubahan evolusioner. Dari 204 gen, dua puluh tujuh adalah sisa-sisa dari urutan memasukkan dan gen asal bakteriofag. Tujuh puluh lima terlibat dalam menjaga fungsi rumah dan 46 dari mutasi gen harus dilakukan dengan interaksi inang.
Ada dua jenis umum digunakan Salmonella typhi, CT18 dan Ty2. Salmonella typhi CT18 memiliki kromosom melingkar besar yang terdiri dari 4,8 Mb dan dua plasmid, pHCM1 dan pHCM2, salah satu yang memiliki resistensi obat ganda (pHCM1). Salmonella typhi Ty2 memiliki satu kromosom besar yang adalah 4,7 Mb dan tidak seperti CT18, tidak memiliki plasmid dan dapat dipengaruhi oleh antibiotik. Bahkan, vaksin ini dikembangkan menggunakan Ty2 S. typhi. Keluar dari pseudogen 204 dalam Salmonella, 195 gen yang sama di kedua strain CT18 dan Ty2, membuat mereka 98% identik (1,5).
Genom untuk Salmonella typhi telah sepenuhnya diurutkan. Ada sekitar 204 pseudogen dikodekan dalam Salmonella typhi. Sebagian besar gen ini telah dilemahkan oleh kodon stop, yang menunjukkan bahwa gen baru-baru ini dimodifikasi karena perubahan evolusioner. Dari 204 gen, dua puluh tujuh adalah sisa-sisa dari urutan memasukkan dan gen asal bakteriofag. Tujuh puluh lima terlibat dalam menjaga fungsi rumah dan 46 dari mutasi gen harus dilakukan dengan interaksi inang.
Ada dua jenis umum digunakan Salmonella typhi, CT18 dan Ty2. Salmonella typhi CT18 memiliki kromosom melingkar besar yang terdiri dari 4,8 Mb dan dua plasmid, pHCM1 dan pHCM2, salah satu yang memiliki resistensi obat ganda (pHCM1). Salmonella typhi Ty2 memiliki satu kromosom besar yang adalah 4,7 Mb dan tidak seperti CT18, tidak memiliki plasmid dan dapat dipengaruhi oleh antibiotik. Bahkan, vaksin ini dikembangkan menggunakan Ty2 S. typhi. Keluar dari pseudogen 204 dalam Salmonella, 195 gen yang sama di kedua strain CT18 dan Ty2, membuat mereka 98% identik (1,5).
Struktur sel dan metabolisme
Salmonella typhi adalah berbentuk batang, gram negatif bakteri yang mengandung fitur yang memisahkan diri dari jenis bakteri lain yang meliputi: memiliki 2 membran (dan luar dan dalam), periplasm, dan rantai Lipopollysaccharide yang terdiri dari α-D-galactosyl - (1 → 2)-α-D-mannosyl-(1 → 4)-l-rhamnosyl-(1 → 3)-mengulang unit, dan memiliki cabang pendek tunggal 3,6-dideoxyhexose residu .
Salmonella typhi memiliki sistem peraturan yang kompleks, yang menengahi respon terhadap perubahan lingkungan eksternalnya. Faktor sigma, yang adalah regulator global yang mengubah spesifisitas RNA polimerase, adalah contoh dari peraturan tersebut. Beberapa faktor transkripsi sigma langsung untuk memproduksi protein stres, yang meningkatkan kemungkinan bakteri bertahan perubahan lingkungan.RNA polimerase S diproduksi sebagai respon terhadap kelaparan dan perubahan pH dan suhu. Hal ini juga mengatur ekspresi hingga 50 protein lain dan juga terlibat dalam regulasi plasmid virulensi.
Dalam rangka untuk bertahan dalam organ usus dari host mana ada tingkat rendah oksigen, Salmonella typhi harus mampu belajar untuk menggunakan sumber-sumber lain selain oksigen sebagai akseptor elektron. Oleh karena itu, Salmonella telah beradaptasi untuk tumbuh di bawah kedua suatu kondisi aerobik dan anaerobik. Sumber Salmonella yang paling umum dari elektron akseptor adalah nitrogen. Contoh akseptor elektron lainnya adalah: nitrat, nitrit, fumarat, dan dimethlysulphoxide. Sistem regulasi global dan spesifik ekspresi gen anaerobik, seperti yang disebutkan di atas, diterapkan untuk memastikan bahwa proses metabolisme yang paling energetik digunakan. Bukti menunjukkan bahwa ketersediaan oksigen adalah sinyal lingkungan yang mengontrol virulensi Salmonella itu .
Salmonella typhi adalah berbentuk batang, gram negatif bakteri yang mengandung fitur yang memisahkan diri dari jenis bakteri lain yang meliputi: memiliki 2 membran (dan luar dan dalam), periplasm, dan rantai Lipopollysaccharide yang terdiri dari α-D-galactosyl - (1 → 2)-α-D-mannosyl-(1 → 4)-l-rhamnosyl-(1 → 3)-mengulang unit, dan memiliki cabang pendek tunggal 3,6-dideoxyhexose residu .
Salmonella typhi memiliki sistem peraturan yang kompleks, yang menengahi respon terhadap perubahan lingkungan eksternalnya. Faktor sigma, yang adalah regulator global yang mengubah spesifisitas RNA polimerase, adalah contoh dari peraturan tersebut. Beberapa faktor transkripsi sigma langsung untuk memproduksi protein stres, yang meningkatkan kemungkinan bakteri bertahan perubahan lingkungan.RNA polimerase S diproduksi sebagai respon terhadap kelaparan dan perubahan pH dan suhu. Hal ini juga mengatur ekspresi hingga 50 protein lain dan juga terlibat dalam regulasi plasmid virulensi.
Dalam rangka untuk bertahan dalam organ usus dari host mana ada tingkat rendah oksigen, Salmonella typhi harus mampu belajar untuk menggunakan sumber-sumber lain selain oksigen sebagai akseptor elektron. Oleh karena itu, Salmonella telah beradaptasi untuk tumbuh di bawah kedua suatu kondisi aerobik dan anaerobik. Sumber Salmonella yang paling umum dari elektron akseptor adalah nitrogen. Contoh akseptor elektron lainnya adalah: nitrat, nitrit, fumarat, dan dimethlysulphoxide. Sistem regulasi global dan spesifik ekspresi gen anaerobik, seperti yang disebutkan di atas, diterapkan untuk memastikan bahwa proses metabolisme yang paling energetik digunakan. Bukti menunjukkan bahwa ketersediaan oksigen adalah sinyal lingkungan yang mengontrol virulensi Salmonella itu .
Ekologi
Salmonella typhi merupakan patogen makanan lahir dan yang semakin sulit dikendalikan. Salmonella kemampuan untuk mengubah fenotipe dan genotipe dalam menanggapi perubahan lingkungan membuat hampir tidak mungkin untuk membasmi dari rantai makanan. Ketika sebuah budaya Salmonella ditransfer ke suhu yang lebih tinggi (60 C), butuh 60 menit untuk memaksimalkan tahan panas.Bila pH diturunkan, tahan asam meningkat. Waktu yang dibutuhkan untuk membunuh 90% adalah 4-14 menit. Sel Salmonella mengalami perubahan bertahap
yang mengapa Salmonella tumbuh subur di daging yang kurang matang.Hal ini dapat beradaptasi untuk bertahan hidup proses memasak dan juga memiliki kemampuan untuk menyeberangi penghalang asam lambung (ini adalah bagaimana mereka memasuki usus manusia). Sebuah matriks tinggi lemak adalah melindungi Salmonella terhadap stres lingkungan ini .
| 5. Alicaligenes taecalis / Alicaligenes vicasus kelompok 4 |
| Kingdom: | |
| Phylum: | |
| Class: | |
| Order: | |
| Family: | |
| Genus: | |
| Species: | A. faecalis |
Alcaligenes faecalis adalah Gram-negatif, berbentuk batang, motil, non-nitratmengurangi, oksidase positif, katalase positif, hemolitik beta, dan sitrat aerobobligat positif yang umum ditemukan di lingkungan. Itu awalnya bernama untuk penemuan pertama dalam kotoran, tetapi kemudian ditemukan jauh lebih umum di tempat lain juga. Pertumbuhan optimal terjadi pada sekitar 37 ° C denganpigmentasi tidak. Sementara infeksi oportunistik terjadi, bakteri umumnya dianggapnon-patogen. Ketika infeksi oportunistik tidak terjadi, biasanya diamati dalam bentukinfeksi saluran kemih. Bakteri mendegradasi urea, menciptakan amonia yang meningkatkan pH lingkungan. Meskipun A. faecalis dianggap basa toleran, ia mempertahankan pH netral dalam sitosol untuk mencegah denaturasi merusak atauspesies yang diisi dan makromolekul.
A. faecalis telah digunakan untuk produksi non-standar asam amino. A. faecalisbiasanya ditemukan di tanah, air, dan lingkungan dalam hubungannya dengan manusia.
A. faecalis telah digunakan untuk produksi non-standar asam amino. A. faecalisbiasanya ditemukan di tanah, air, dan lingkungan dalam hubungannya dengan manusia.
Kingdom Bacteria
Phylum Proteobacteria
Class Betaproteobacteria
Order Burkholderiales
Family Alcaligenaceae
Genus Alcaligenes
Species Alcaligenes viscosus
Dalam buku teks ilmu makanan, orang sering membaca tentang
cacat yang dihasilkan mikroba dalam susu disebut sebagai
"Kekentalan". Susu kental (RM) ditandai dengan nya
kecenderungan untuk melekat pada permukaan dan membentuk berlendir
benang ketika permukaan yang terpasang adalah ditarik terpisah . Lendir tampaknya menjadi
kapsuler diproduksi oleh bakteri Levan psychrophilic kontaminan dalam susu . Meskipun RM wabah
selama 50 tahun terakhir telah dikaitkan untuk organisme yang berbeda, organisme satu
paling sering dikutip sebagai agen penyebab adalah "Alcaligenes viscolactis "atau" Alcaligenes viscosus " . Seperti dijelaskan dalam edisi ketujuh Bergey 's manual , fitur pembeda utama
organisme ini adalah kemampuannya untuk menyebabkan RM; nya karakteristik terdaftar lainnya tidak membedakan itu dari spesies lain beberapa bakteri Gram-negatif.
Strain Jenis Alcaligenes viscolactis (ATCC 9036) dimasukkan dalam sebuah studi yang luas
dari bakteri Gram-negatif dari kelompok Moraxella dan, berdasarkan analisis numerik, ternyata
untuk menjadi anggota kelompok "B2" dari genus untuk
yang nama Acinetobacter disarankan . Namun, tidak ada kesimpulan tentang status RM
bakteri pada umumnya diambil dalam penelitian bahwa karena tidak ada strain diperiksa, termasuk
ATCC 9036, tampaknya menyebabkan kekentalan benar dalam Kepada siapa permintaan mencetak ulang harus ditangani.
susu. Hasil studi taksonomi lainnya – dalam strain yang ditunjuk sebagai Alcaligenes viscolactis
atau viscosus A. telah dimasukkan - berada di
parsial perjanjian dengan temuan bahwa studi dalam kebanyakan isolat yang jatuh RM dalam genus
Acinetobacter, meskipun beberapa strain dengan sebutan Viscosus Alcaligenes telah menunjukkan lebih keterkaitan dengan strain dari genus Alcaligenes. Sebagai
hasil dari kebingungan identitas RM bakteri, dan fakta bahwa strain jenis Alcaligenes viscolactis menyerupai Acinetobacter spp. lebih dari Alcaligenes spp, yang Alcaligenes nama.
viscolactis tidak termasuk dalam delapan
Bergey Manual edisi ini .
cacat yang dihasilkan mikroba dalam susu disebut sebagai
"Kekentalan". Susu kental (RM) ditandai dengan nya
kecenderungan untuk melekat pada permukaan dan membentuk berlendir
benang ketika permukaan yang terpasang adalah ditarik terpisah . Lendir tampaknya menjadi
kapsuler diproduksi oleh bakteri Levan psychrophilic kontaminan dalam susu . Meskipun RM wabah
selama 50 tahun terakhir telah dikaitkan untuk organisme yang berbeda, organisme satu
paling sering dikutip sebagai agen penyebab adalah "Alcaligenes viscolactis "atau" Alcaligenes viscosus " . Seperti dijelaskan dalam edisi ketujuh Bergey 's manual , fitur pembeda utama
organisme ini adalah kemampuannya untuk menyebabkan RM; nya karakteristik terdaftar lainnya tidak membedakan itu dari spesies lain beberapa bakteri Gram-negatif.
Strain Jenis Alcaligenes viscolactis (ATCC 9036) dimasukkan dalam sebuah studi yang luas
dari bakteri Gram-negatif dari kelompok Moraxella dan, berdasarkan analisis numerik, ternyata
untuk menjadi anggota kelompok "B2" dari genus untuk
yang nama Acinetobacter disarankan . Namun, tidak ada kesimpulan tentang status RM
bakteri pada umumnya diambil dalam penelitian bahwa karena tidak ada strain diperiksa, termasuk
ATCC 9036, tampaknya menyebabkan kekentalan benar dalam Kepada siapa permintaan mencetak ulang harus ditangani.
susu. Hasil studi taksonomi lainnya – dalam strain yang ditunjuk sebagai Alcaligenes viscolactis
atau viscosus A. telah dimasukkan - berada di
parsial perjanjian dengan temuan bahwa studi dalam kebanyakan isolat yang jatuh RM dalam genus
Acinetobacter, meskipun beberapa strain dengan sebutan Viscosus Alcaligenes telah menunjukkan lebih keterkaitan dengan strain dari genus Alcaligenes. Sebagai
hasil dari kebingungan identitas RM bakteri, dan fakta bahwa strain jenis Alcaligenes viscolactis menyerupai Acinetobacter spp. lebih dari Alcaligenes spp, yang Alcaligenes nama.
viscolactis tidak termasuk dalam delapan
Bergey Manual edisi ini .
6. Providencia heimbachae kelompok 5
Kerajaan: Bakteri
Filum: Proteobacteria
Kelas: Gammaproteobacteria
Urutan: Enterobacteriales
Keluarga: Enterobacteriaceae
Genus: Providencia
Spesies : P. heimbachae
Nama heimbachae Providencia sp. November diusulkan untuk kelompok organisme yang diisolasi dari tinja penguin di Republik Federal Jerman dan dari sapi di Amerika Serikat. P. heimbachae strain gram negatif, oksidase-negatif, fermentasi, organisme berbentuk batang yang tumbuh pada agar-agar MacConkey, serta media lain yang selektif untuk anggota Enterobacteriaceae. Ke-13 isolat P. heimbachae yang kita pelajari memberikan hasil negatif untuk tes berikut: produksi indol, Voges-Proskauer, Simmons sitrat, H2S produksi pada besi gula triple dan agars Kligler, urease, dekarboksilase lisin, arginin dihydrolase, gelatinase, pertumbuhan di kehadiran KCN, malonat, asam produksi dari L-arabinosa, cellobiose, dulcitol, eritritol, laktosa, melezitose, melibiose, sebuah methylglucoside-, raffinose, salisin, D-sorbitol, L-sorbose, pati, D-tagatose, trehalosa, D -turanose, dan D-xilosa (15% positif setelah 7 hari), esculin hidrolisis, asetat, lipase, deoxyribonuclease, dan o-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside. Strain positif untuk tes berikut: katalase, nitrat reduktase, methy1 merah, deaminase fenilalanin, asam produksi dari D-glukosa, adonitol, D-arabitol, D-fruktosa, D-galaktosa, D-manosa, dan L-rhamnose, dan tirosin kliring. Asam produksi dari gliserol, myo-inositol, maltosa, dan D-manitol ditunda; gas yang diproduksi dari D-glukosa, D-galaktosa, dan D-manosa dalam jumlah kecil atau tidak sama sekali (54% positif setelah 7 hari). Motilitas pada 36 ° C variabel adalah (46% positif setelah 2 hari, 85% positif setelah 7 hari). Asam deoksiribonukleat dari 12 strain lainnya dari P. heimbachae sangat berkaitan (91 hingga 100% terkait dalam reaksi diuji pada hidroksiapatit pada 60 dan 75 ° C) untuk 32P-berlabel asam deoksiribonukleat dari strain tipe yang diusulkan (strain ATCC 35613). Asam deoksiribonukleat berlabel dari strain tipe adalah 22 sampai 45% terkait pada 60 ° C dan 4 untuk 31% terkait pada suhu 75 ° C untuk asam deoksiribonukleat dari empat spesies Providencia lainnya. Tingkat keterkaitan P. heimbachae untuk spesies Proteus berkisar antara 10 sampai 13% dalam 60 ° C reaksi. P. heimbachae dapat dibedakan dari spesies Providencia lain dengan karakteristik sebagai berikut: tes negatif untuk Simmons sitrat, urease, produksi indol, dan produksi asam dari trehalosa dan tes positif untuk produksi asam dari adonitol, D-arabitol, D-galaktosa, dan L-rhamnose. Semua strain P. heimbachae yang kami pelajari resisten terhadap tetrasiklin, dan strain yang paling resisten terhadap sefalotin.
7. Shigella sonnei kelompok 7
| Kingdom: | |
| Phylum: | |
| Class: | |
| Order: | |
| Family: | |
| Genus: | |
| Species: | S. sonnei |
Shigella sonnei adalah non-motil, nonspore-membentuk, fakultatif anaerob bakteri Gram-negatif. Non-motil berarti karakteristik bahwa spesies ini tidak memiliki flagela untuk memfasilitasi pergerakan yang seperti banyak enterobacteria manusia lainnya. Shigella sonnei adalah bakteri batang-bentuk dan merupakan bakteri fermentasi laktosa menyebabkan disentri . Shigella sonnei sangat rapuh dalam pengaturan percobaan. Habitat alami adalah dalam lingkungan pH rendah seperti saluran pencernaan manusia. Suhu optimal lingkungan adalah 37 derajat Celcius, sama dengan suhu dalam tubuh manusia. Oleh karena itu, saluran pencernaan manusia tampaknya menjadi tuan rumah alami hanya ditemukan Shigella sonnei yang kita ketahui sejauh ini.
Shigella sonnei pertama kali berhasil diisolasi dari pasien berusia 5 tahun di Jepang . Ini adalah bakteri yang terkait erat dengan E. coli. Hal itu diketahui dari awal bahwa Shigella sonnei berhubungan dengan E. coli, bagaimanapun, Shigella telah berkembang dari strain yang berbeda dari E. coli. Karena rute evolusi jauh dari kesamaan dari genom E. coli, Shigella telah diklasifikasikan sebagai spesies lain. Karena Shigella yang sangat berkembang genom, ini telah menjadi patogen manusia yang sangat spesifik karena kemajuan evolusioner yang luas melibatkan keuntungan terus-menerus dan hilangnya fungsi komparatif untuk E. coli .
Di kedua negara maju dan berkembang, penyakit Shigellosis enterik menular, yang disebabkan oleh Shigella sonnei infeksi, telah menjadi penyebab paling umum dari endemik pada mereka areas.S. sonnei terus menjadi ancaman yang bertalian dengan makanan utama untuk kesehatan masyarakat di banyak negara maju di mana isu sanitasi dimonitor secara ketat. Enterobacterium ini umumnya ditularkan oleh makanan mentah atau air yang terkontaminasi. Di AS, kasus 70% dari Shigellosis disebabkan oleh Shigella sonnei .
Struktur Genom
Shigella sonnei memiliki genom DNA sirkular. Ini menggunakan kode gen kromosom dan plasmid baik untuk virulensi nya . Spesies ini telah mengalami untuk menyelesaikan sekuensing genom. Ini memiliki ukuran genom ~ 4Mb.Kromosom Shigella sonnei memiliki asal yang sama dan terminus replikasi seperti yang E. coli, ini tidak hanya berarti bahwa mereka secara evolusi terkait tetapi menunjukkan bahwa kemungkinan besar mereka menggunakan mekanisme seluler yang sama untuk meniru. Ada sifat biokimia sangat sedikit yang dapat membedakan Shigella sonnei dari E. coli. Dalam semua genom Shigella, operon rRNA, urutan yang sangat kekal antara prokariota, peta kira-kira posisi yang relatif sama seperti di E. coli menunjukkan bahwa Shigella sonnei dan E. coli tidak melalui rekombinasi DNA antara operon rRNA .
Fitur yang paling menarik tentang Shigella sonnei dan semua spesies lain dari Shigella adalah bahwa genom mereka sangat dinamis . Mereka knalpot penggunaan elemen urutan penyisipan (IS-elemen) dalam menggambarkan genom mereka dinamis dalam hal menyebabkan penataan ulang DNA konstan seperti penghapusan, translokasi, dan inversi . Ini adalah melalui penggunaan IS-elemen yang berbeda dari kumparan E. spesies Shigella lainnya. Ini adalah bukti bahwa kromosom Shigella memiliki situs inversi pada asal-usulnya dari situs replikasi dan Termini yang dapat memungkinkan rekombinasi "hotspot" untuk penyisipan unsur bergerak bakteri lain genom . Hal ini juga melalui penggunaan IS-elemen yang Shigella Shigella sonnei dan spesies dapat dicirikan sebagai sangat virulen.Seperti semua spesies Shigella lainnya, Shigella sonnei memiliki plasmid yang meningkatkan toksisitas dari mikroba untuk menjadi tuan rumah mereka atau organisme lain di sekitar mereka. Mereka menghasilkan suatu racun yang disebut "racun Shiga". Ini adalah semacam unik dari toksin yang bekerja toksisitas dalam tubuh dalam berbagai cara yang akan membawa potensi bahaya ke neuron, sitoplasma sel dan sel-sel epitel enterik.
Struktur sel dan metabolisme
Shigella sonnei adalah bentuk batang, Gram-negatif bakteri. Membran luarnya diisi dengan lipopolyscharride (LPS), karakteristik umum dari bakteri Gram-negatif.Komponen O-antigen LPS di Shigella sonnei ditandai berbeda antara spesies lain dari Shigella. Selain itu, LPS dari bakteri ini memainkan peran penting dalam virulensi bakteri.
Sejauh ini kita hanya tahu bahwa Shigella sonnei dapat bertahan dalam tubuh manusia, oleh karena itu, mekanisme infeksi S. sonnei mendefinisikan kemampuan untuk hidup. S. sonnei, seperti spesies Shigella yang paling, menghabiskan sebagian besar waktu selama infeksi intraseluler dan sangat mobile dalam sel dengan polimerisasi aktin.
Tidak seperti banyak bakteri patogen lainnya, S. sonnei tidak menggunakan flagela untuk chemotoxicity dan invasi jaringan. Tanpa flagela, S. sonnei sering dapat melepaskan diri dari sistem kekebalan tubuh manusia dari TLR-5 (pulsa seperti reseptor) yang biasanya menengahi imunitas bawaan dan adaptif dengan mendeteksi domain dilestarikan pada bakteri yang menggunakan flagellin untuk motilitas . Meskipun S. sonnei tidak dapat dianggap sebagai bakteri motil karena tidak memiliki flagellin untuk gerakan, namun, ia memfasilitasi gerakan dengan menggunakan mekanisme atipikal motilitas, polimerisasi aktin oleh.Mekanisme tersebut tidak dikenal oleh sistem kekebalan tubuh manusia dan juga merupakan jenis mekanisme motil yang menghemat energi .
Metabolisme:
Fermentasi laktosa adalah properti biokimia umum digunakan untuk untuk membedakan Shigella dari bakteri coli E. terkait erat. Namun, isolat S. sonnei memfermentasi laktosa pada banyak proses yang lebih lambat dibandingkan spesies lain dari Shigella . Sifat biokimia yang unik dari S. sonnei dapat dijelaskan genetik. Dalam genom Sd197 dan Ss046 gen kunci lacZ, pengkodean beta-D-galaktosidase, yang melekat pada pengkodean gen untuk fungsi transportasi lacY galaktosa. Banyak dari gen dalam S. sonnei dikategorikan sebagai pseudogen. Pseudogen adalah urutan genetik secara sporadis terletak di S. sonnei genom. Mereka tunduk pada peluruhan pada waktu tertentu. Sifat dan tujuan masih tetap sulit dipahami pseudogene . Hasil dari sporadis hilang gen transportasi galactoside fungsional di S. sonnei menjelaskan proses fermentasi laktosa lambat karena fakta bahwa pseudogene tunduk pada konstanta peluruhan dari situs aslinya dari daerah dikodekan awal .
Banyak mekanisme metabolisme S. sonnei tetap sulit karena dianggap menjadi mahluk yang lebih berkembang dari serogrup Shigella lainnya. S. sonnei dikenal kurang virulen dibandingkan spesies Shigella lain karena tidak membunuh inangnya segera. Mungkin ini juga menjelaskan mengapa S. sonnei sekarang Shigellosis paling umum yang menyebabkan spesies yang meliputi sebagian besar negara-negara maju.
Ekologi
Host utama dan reservoir alami diketahui pada titik ini untuk Shigella sonnei dan di antara semua spesies lain dari Shigella adalah saluran pencernaan manusia.Shigella dapat bertahan hidup dalam material terkontaminasi tinja namun memiliki tingkat kelangsungan hidup rendah tanpa lingkungan asam yang optimal dalam saluran usus sebagai sekitarnya. Bakteri ini dikenal untuk dapat bertahan hidup di linen kotor sampai tujuh minggu. Dalam lingkungan air tawar, dapat hidup sampai 5 hari dan di air garam selama 12-30 jam. Telah dicatat bahwa Shigella sonnei tidak dapat bertahan hidup pada permukaan halus tomat .
Tidak ada kasus yang diketahui orang lain reservoir alami telah terbukti menjadi tuan rumah alami Shigella sonnei selain saluran usus manusia. Beberapa penyelidikan telah meneliti kemungkinan hidup bebas bakteri Shigella melanda amuba sebagai modus panen Shigella sonnei di lingkungan luar host manusia.Amuba adalah bentuk kehidupan mikroskopis yang uniseluler memiliki kemampuan untuk hidup dalam lingkungan tanpa host. Mereka dapat berubah bentuk dan sel lainnya menelan. Banyak yang belum diketahui tentang asal usul dan pembentukan sel-sel ini fenomenal. Telah ditunjukkan eksperimen bahwa amuba yang hidup bebas spesies Acanthamoeba memiliki kemampuan untuk penyerapan S. sonnei virulen dan non-virulen. Amuba ini dapat mempromosikan pertumbuhan banyak bakteri patogen yang berbeda di dalam kista mereka dalam pengaturan percobaan, yang memberikan bakteri patogen seperti Shigella sonnei sebuah microhabitat yang melindungi mereka dari lingkungan luar. Namun, menemukan alami biaya hidup amuba panen Shigella sonnei belum ditemukan, karena itu, tuan rumah mungkin untuk Shigella sonnei selain saluran pencernaan manusia masih tetap merupakan faktor yang sulit dipahami .
Shigella sonnei pertama kali berhasil diisolasi dari pasien berusia 5 tahun di Jepang . Ini adalah bakteri yang terkait erat dengan E. coli. Hal itu diketahui dari awal bahwa Shigella sonnei berhubungan dengan E. coli, bagaimanapun, Shigella telah berkembang dari strain yang berbeda dari E. coli. Karena rute evolusi jauh dari kesamaan dari genom E. coli, Shigella telah diklasifikasikan sebagai spesies lain. Karena Shigella yang sangat berkembang genom, ini telah menjadi patogen manusia yang sangat spesifik karena kemajuan evolusioner yang luas melibatkan keuntungan terus-menerus dan hilangnya fungsi komparatif untuk E. coli .
Di kedua negara maju dan berkembang, penyakit Shigellosis enterik menular, yang disebabkan oleh Shigella sonnei infeksi, telah menjadi penyebab paling umum dari endemik pada mereka areas.S. sonnei terus menjadi ancaman yang bertalian dengan makanan utama untuk kesehatan masyarakat di banyak negara maju di mana isu sanitasi dimonitor secara ketat. Enterobacterium ini umumnya ditularkan oleh makanan mentah atau air yang terkontaminasi. Di AS, kasus 70% dari Shigellosis disebabkan oleh Shigella sonnei .
Struktur Genom
Shigella sonnei memiliki genom DNA sirkular. Ini menggunakan kode gen kromosom dan plasmid baik untuk virulensi nya . Spesies ini telah mengalami untuk menyelesaikan sekuensing genom. Ini memiliki ukuran genom ~ 4Mb.Kromosom Shigella sonnei memiliki asal yang sama dan terminus replikasi seperti yang E. coli, ini tidak hanya berarti bahwa mereka secara evolusi terkait tetapi menunjukkan bahwa kemungkinan besar mereka menggunakan mekanisme seluler yang sama untuk meniru. Ada sifat biokimia sangat sedikit yang dapat membedakan Shigella sonnei dari E. coli. Dalam semua genom Shigella, operon rRNA, urutan yang sangat kekal antara prokariota, peta kira-kira posisi yang relatif sama seperti di E. coli menunjukkan bahwa Shigella sonnei dan E. coli tidak melalui rekombinasi DNA antara operon rRNA .
Fitur yang paling menarik tentang Shigella sonnei dan semua spesies lain dari Shigella adalah bahwa genom mereka sangat dinamis . Mereka knalpot penggunaan elemen urutan penyisipan (IS-elemen) dalam menggambarkan genom mereka dinamis dalam hal menyebabkan penataan ulang DNA konstan seperti penghapusan, translokasi, dan inversi . Ini adalah melalui penggunaan IS-elemen yang berbeda dari kumparan E. spesies Shigella lainnya. Ini adalah bukti bahwa kromosom Shigella memiliki situs inversi pada asal-usulnya dari situs replikasi dan Termini yang dapat memungkinkan rekombinasi "hotspot" untuk penyisipan unsur bergerak bakteri lain genom . Hal ini juga melalui penggunaan IS-elemen yang Shigella Shigella sonnei dan spesies dapat dicirikan sebagai sangat virulen.Seperti semua spesies Shigella lainnya, Shigella sonnei memiliki plasmid yang meningkatkan toksisitas dari mikroba untuk menjadi tuan rumah mereka atau organisme lain di sekitar mereka. Mereka menghasilkan suatu racun yang disebut "racun Shiga". Ini adalah semacam unik dari toksin yang bekerja toksisitas dalam tubuh dalam berbagai cara yang akan membawa potensi bahaya ke neuron, sitoplasma sel dan sel-sel epitel enterik.
Struktur sel dan metabolisme
Shigella sonnei adalah bentuk batang, Gram-negatif bakteri. Membran luarnya diisi dengan lipopolyscharride (LPS), karakteristik umum dari bakteri Gram-negatif.Komponen O-antigen LPS di Shigella sonnei ditandai berbeda antara spesies lain dari Shigella. Selain itu, LPS dari bakteri ini memainkan peran penting dalam virulensi bakteri.
Sejauh ini kita hanya tahu bahwa Shigella sonnei dapat bertahan dalam tubuh manusia, oleh karena itu, mekanisme infeksi S. sonnei mendefinisikan kemampuan untuk hidup. S. sonnei, seperti spesies Shigella yang paling, menghabiskan sebagian besar waktu selama infeksi intraseluler dan sangat mobile dalam sel dengan polimerisasi aktin.
Tidak seperti banyak bakteri patogen lainnya, S. sonnei tidak menggunakan flagela untuk chemotoxicity dan invasi jaringan. Tanpa flagela, S. sonnei sering dapat melepaskan diri dari sistem kekebalan tubuh manusia dari TLR-5 (pulsa seperti reseptor) yang biasanya menengahi imunitas bawaan dan adaptif dengan mendeteksi domain dilestarikan pada bakteri yang menggunakan flagellin untuk motilitas . Meskipun S. sonnei tidak dapat dianggap sebagai bakteri motil karena tidak memiliki flagellin untuk gerakan, namun, ia memfasilitasi gerakan dengan menggunakan mekanisme atipikal motilitas, polimerisasi aktin oleh.Mekanisme tersebut tidak dikenal oleh sistem kekebalan tubuh manusia dan juga merupakan jenis mekanisme motil yang menghemat energi .
Metabolisme:
Fermentasi laktosa adalah properti biokimia umum digunakan untuk untuk membedakan Shigella dari bakteri coli E. terkait erat. Namun, isolat S. sonnei memfermentasi laktosa pada banyak proses yang lebih lambat dibandingkan spesies lain dari Shigella . Sifat biokimia yang unik dari S. sonnei dapat dijelaskan genetik. Dalam genom Sd197 dan Ss046 gen kunci lacZ, pengkodean beta-D-galaktosidase, yang melekat pada pengkodean gen untuk fungsi transportasi lacY galaktosa. Banyak dari gen dalam S. sonnei dikategorikan sebagai pseudogen. Pseudogen adalah urutan genetik secara sporadis terletak di S. sonnei genom. Mereka tunduk pada peluruhan pada waktu tertentu. Sifat dan tujuan masih tetap sulit dipahami pseudogene . Hasil dari sporadis hilang gen transportasi galactoside fungsional di S. sonnei menjelaskan proses fermentasi laktosa lambat karena fakta bahwa pseudogene tunduk pada konstanta peluruhan dari situs aslinya dari daerah dikodekan awal .
Banyak mekanisme metabolisme S. sonnei tetap sulit karena dianggap menjadi mahluk yang lebih berkembang dari serogrup Shigella lainnya. S. sonnei dikenal kurang virulen dibandingkan spesies Shigella lain karena tidak membunuh inangnya segera. Mungkin ini juga menjelaskan mengapa S. sonnei sekarang Shigellosis paling umum yang menyebabkan spesies yang meliputi sebagian besar negara-negara maju.
Ekologi
Host utama dan reservoir alami diketahui pada titik ini untuk Shigella sonnei dan di antara semua spesies lain dari Shigella adalah saluran pencernaan manusia.Shigella dapat bertahan hidup dalam material terkontaminasi tinja namun memiliki tingkat kelangsungan hidup rendah tanpa lingkungan asam yang optimal dalam saluran usus sebagai sekitarnya. Bakteri ini dikenal untuk dapat bertahan hidup di linen kotor sampai tujuh minggu. Dalam lingkungan air tawar, dapat hidup sampai 5 hari dan di air garam selama 12-30 jam. Telah dicatat bahwa Shigella sonnei tidak dapat bertahan hidup pada permukaan halus tomat .
Tidak ada kasus yang diketahui orang lain reservoir alami telah terbukti menjadi tuan rumah alami Shigella sonnei selain saluran usus manusia. Beberapa penyelidikan telah meneliti kemungkinan hidup bebas bakteri Shigella melanda amuba sebagai modus panen Shigella sonnei di lingkungan luar host manusia.Amuba adalah bentuk kehidupan mikroskopis yang uniseluler memiliki kemampuan untuk hidup dalam lingkungan tanpa host. Mereka dapat berubah bentuk dan sel lainnya menelan. Banyak yang belum diketahui tentang asal usul dan pembentukan sel-sel ini fenomenal. Telah ditunjukkan eksperimen bahwa amuba yang hidup bebas spesies Acanthamoeba memiliki kemampuan untuk penyerapan S. sonnei virulen dan non-virulen. Amuba ini dapat mempromosikan pertumbuhan banyak bakteri patogen yang berbeda di dalam kista mereka dalam pengaturan percobaan, yang memberikan bakteri patogen seperti Shigella sonnei sebuah microhabitat yang melindungi mereka dari lingkungan luar. Namun, menemukan alami biaya hidup amuba panen Shigella sonnei belum ditemukan, karena itu, tuan rumah mungkin untuk Shigella sonnei selain saluran pencernaan manusia masih tetap merupakan faktor yang sulit dipahami .
Klebsiella aerogenes kelompok 11
Klebsiella adalah non-motil, berbentuk batang, bakteri aerobik yang memiliki kapsulpolisakarida menonjol. Beberapa bakteri ini bisa menghasilkan sebuah kompleksberacun ekstraselular yang telah terbukti menjadi "mematikan bagi paru-paru dan menghasilkan patologi yang luas pada tikus" (Straus 1986). Hal ini terdiri dari polisakarida kapsuler 63%, lipopolisakarida 30%, dan protein 7%, ketikadiperkenalkan kepada hewan percobaan dalam dosis sublethal, binatang dibangunimunisasi karena produksi antibodi (Straus 1986).
K Aerogenes ., seperti mikroorganisme lain, menggunakan L-glutanime sebagai kunci metabolit dalam metabolisme nitrogen. Nitrogen amida dari glutamin adalah penting dalam biosintesis asparagin, glukosamin 6-fosfat, triptofan, histidin,carbamyl fosfat, p-aminobenzoate, adenosin, 5'-monofosfat, sitosin 5'-trifosfat,guanosin 5'-monofosfat, glutamat, dan asam amino lainnya. Kelompok alfa-aminoglutamin juga dipindahkan ke asam alfa-keto dalam reaksi transaminasi. Semuareaksi ini memungkinkan biosintesis untuk asimilasi NH3 ke dalam semua asam amino (Senior 1975).
Dalam evironment dengan konsentrasi tinggi amonia dan / atau nitrogen organik,bagaimanapun, ini fiksasi nitrogen tidak akan diperlukan. Dalam K aerogenes .,konsentrasi amonia yang rendah dan / atau nitrogen organik menyebabkan represidari glutamat dehidrogenase dan induksi sintase glutamat, pemasok alternatifglutamat dalam sel, hal ini berbeda dari E. coli yang glutamat dehidrogenase secara progresif diinduksi selama pembatasan nitrogen.
Dalam evironment dengan konsentrasi tinggi amonia dan / atau nitrogen organik,bagaimanapun, ini fiksasi nitrogen tidak akan diperlukan. Dalam K aerogenes .,konsentrasi amonia yang rendah dan / atau nitrogen organik menyebabkan represidari glutamat dehidrogenase dan induksi sintase glutamat, pemasok alternatifglutamat dalam sel, hal ini berbeda dari E. coli yang glutamat dehidrogenase secara progresif diinduksi selama pembatasan nitrogen.
Kingdom Bacteria
Phylum Proteobacteria;
Class Gammaproteobacteria;
Order Enterobacteriales;
Famili Enterobacteriaceae
Genus klebsiella
Spesies Klebsiella aerogenes
Actinomycetes kelompok 12
Actinobacteria atau Actinomycetes adalah kelompokbakteri Gram positif dengan nisbah G/C yang tinggi. Bakteri ini pernah diklasifikasi sebagai fungi (jamur, Mycota) karena ada anggotanya yang membentuk berkas-berkas mirip hifaserta menghasilkan antibiotik. Ketika diketahui memiliki sejumlah ciri bakteri (ukurannya kecil dan dapat diserangvirus bakteriofag), kelompok ini pernah dianggap bukan fungi maupun bakteri. Baru setelah pengujian DNAdimungkinkan, kelompok ini diketahui sebagai bakteri.
Kebanyakan Actinobacteria ditemukan di tanah. Sebagian yang lain tinggal di dalam tumbuhan dan hewan, termasuk beberapa patogen sebertiMycobacterium.
Mereka memainkan peranan yang penting dalam dekomposisi materi organik seperti selulosa dankitin. Aktivitas ini menambah cadangan hara di dalam tanah dan merupakan bagian penting dari pembentukan humus. Kemampuan Actinobacteria untuk hidup di lingkungan bernutrisi rendah dan untuk mengonsumsi lognoselulosa (lignin dan selulosa, zat-zat penyusun kayu, biasanya sukar dicerna kebanyakan bakteri tanah) menyebabkan Actinobacteria mendominasi kawasan bebatuankarst. Pemberian pupuk kandang yang kaya selulosa akan meningkatkan populasi Aktinobakteri di tanah. Pemupukan amonium atau nitrat yang terus-menerus menekan populasi karena Aktinobakteri tidak suka pH di bawah 6; sebaliknya, pengapuran untuk menaikkan pH juga menaikkan populasinya.
Anggota Actinobacteria kebanyakan aerob, tapi beberapa, seperti Actinomyces israelii, dapat tumbuh dalam kondisi anaerob. Tidak seperti Firmicutes, kelompok utama lain bakteria Gram positif, Actinobacteria memiliki DNA dengan GC-content yang tinggi dan beberapa jenis Actinobacteria memproduksi spora eksternal.
Shigella shigae(s.dysenterieae) kelompok 14
S. dysenteriae adalah kecil, tidak berkapsul, non-motil, Gram-negatif basil (berbentuk batang). Ini tidak membentuk spora.
Habitat: S. dysenteriae ditemukan di seluruh dunia tetapi berkonsentrasi di daerah di mana penduduk menderita kekurangan gizi dan berdesak-desakan dan tidak memiliki pengelolaan limbah yang memadai dan pasokan air minum yang aman. S. dysenteriae telah menyebabkan disentri endemik di Afrika, Asia Tenggara, dan anak benua India. Manusia adalah satu-satunya host alami untuk S. dysenteriae, meskipun lalat dapat berfungsi sebagai vektor untuk transmisi S. dysenteriae.Meskipun S. dysenteriae telah ditemukan dalam makanan dan air yang terkontaminasi, organisme ini umumnya bertahan buruk di luar tubuh manusia.
Signifikansi: S. dysenteriae menyebabkan ancaman yang signifikan terhadap kesehatan masyarakat dengan menyebabkan Shigellosis, terutama di negara-negara berkembang. Shigellosis terkait dengan 5-15% kasus diare dan 30-50% kasus disentri di seluruh dunia. Pada anak-anak kurang gizi, Shigellosis dapat menyebabkan lingkaran setan "absoprtion gangguan gizi lanjut, infeksi berulang, dan keterbelakangan pertumbuhan." Tanpa perawatan yang tepat, Shigellosis bisa menjadi hidup mengancam. Hal ini penting untuk genom S. dysenteriae yang akan diurutkan karena pemahaman dari genom organisme ini mungkin berkontribusi terhadap keberhasilan pengembangan vaksin, yang masih dalam pengembangan di laboratorium (lihat Penelitian Current).
S. dysenteriae pertama kali diisolasi oleh Kiyoshi Shiga pada tahun 1896 dari tinja penderita disentri. Ketika budaya organisme diumpankan ke anjing, diare terjadi. Dia menegaskan S. dysenteriae sebagai penyebab disentri pada pasien dengan teknik aglutinasi sederhana. Shiga menunjukkan bahwa organisme berulang kali bersatu bila terkena serum pasien disentri. Pada tahun-tahun segera setelah penemuan Shiga itu, organisme serupa dilaporkan oleh peneliti lain, dan selama 40 tahun berikutnya tiga organisme yang terkait tambahan taksonomi ditempatkan dalam genus Shigella flexneri dan bernama S., S. boydii, dan S. Sonnei
Habitat: S. dysenteriae ditemukan di seluruh dunia tetapi berkonsentrasi di daerah di mana penduduk menderita kekurangan gizi dan berdesak-desakan dan tidak memiliki pengelolaan limbah yang memadai dan pasokan air minum yang aman. S. dysenteriae telah menyebabkan disentri endemik di Afrika, Asia Tenggara, dan anak benua India. Manusia adalah satu-satunya host alami untuk S. dysenteriae, meskipun lalat dapat berfungsi sebagai vektor untuk transmisi S. dysenteriae.Meskipun S. dysenteriae telah ditemukan dalam makanan dan air yang terkontaminasi, organisme ini umumnya bertahan buruk di luar tubuh manusia.
Signifikansi: S. dysenteriae menyebabkan ancaman yang signifikan terhadap kesehatan masyarakat dengan menyebabkan Shigellosis, terutama di negara-negara berkembang. Shigellosis terkait dengan 5-15% kasus diare dan 30-50% kasus disentri di seluruh dunia. Pada anak-anak kurang gizi, Shigellosis dapat menyebabkan lingkaran setan "absoprtion gangguan gizi lanjut, infeksi berulang, dan keterbelakangan pertumbuhan." Tanpa perawatan yang tepat, Shigellosis bisa menjadi hidup mengancam. Hal ini penting untuk genom S. dysenteriae yang akan diurutkan karena pemahaman dari genom organisme ini mungkin berkontribusi terhadap keberhasilan pengembangan vaksin, yang masih dalam pengembangan di laboratorium (lihat Penelitian Current).
S. dysenteriae pertama kali diisolasi oleh Kiyoshi Shiga pada tahun 1896 dari tinja penderita disentri. Ketika budaya organisme diumpankan ke anjing, diare terjadi. Dia menegaskan S. dysenteriae sebagai penyebab disentri pada pasien dengan teknik aglutinasi sederhana. Shiga menunjukkan bahwa organisme berulang kali bersatu bila terkena serum pasien disentri. Pada tahun-tahun segera setelah penemuan Shiga itu, organisme serupa dilaporkan oleh peneliti lain, dan selama 40 tahun berikutnya tiga organisme yang terkait tambahan taksonomi ditempatkan dalam genus Shigella flexneri dan bernama S., S. boydii, dan S. Sonnei
Domain Bacteria
phylum Proteobacteria
class Gammaproteobacteria
order Enterobacteriales
family Enterobacteriaceae
genus Shigella
species S. dysenteriae (shigae)
serratia kelompok 16
Serratia adalah genus dari Gram-negatif, fakultatif anaerob, bakteri berbentuk batang dari keluarga Enterobacteriaceae. Spesies yang paling umum dalam genus,S. marcescens, biasanya hanya patogen dan biasanya menyebabkan infeksinosokomial. Namun, strain langka S. plymuthica, S. liquefaciens, S. rubidaea, dan S.odoriferae telah menyebabkan penyakit melalui infeksi. Anggota dari genus ini menghasilkan pigmen merah karakteristik, prodigiosin, dan dapat dibedakan darianggota lain dari keluarga Enterobacteriaceae oleh produksi unik dari tiga enzim:DNase, lipase, dan gelatinase
.
| Kingdom: | |
| Phylum: | |
| Class: | |
| Order: | |
| Family: | |
| Genus: | Serratia Bizio 1823 |
Hafnia kelompok 17
| Kingdom: | |
| Phylum: | |
| Class: | |
| Order: | |
| Family: | |
| Genus: | Hafnia Møller, 1954 |
Hafnia adalah genus dari keluarga Enterobacteriaceae yang hanya spesies adalahGram-negatif, fakultatif anaerob, bakteri berbentuk batang Hafnia alvei.
H. alvei adalah komensal dari saluran pencernaan manusia dan biasanya tidakpatogen, tetapi dapat menyebabkan penyakit pada pasien immunocompromised.Hal ini sering resisten terhadap antibiotik beberapa termasuk Aminopenicillins.
H. alvei adalah komensal dari saluran pencernaan manusia dan biasanya tidakpatogen, tetapi dapat menyebabkan penyakit pada pasien immunocompromised.Hal ini sering resisten terhadap antibiotik beberapa termasuk Aminopenicillins.
Hafnia alvei adalah basil gram negatif, awalnya diisolasi dari swab tenggorokandari pasien di ITU. H. alvei sebelumnya ditempatkan di genus Enterobacter, tetapi DNA-DNA hibridisasi penelitian telah menunjukkan bahwa organisme ini layakstatus generik dipisahkan. Strain ini tumbuh baik pada media laboratorium umum,namun H. Alevi fermentasi berbagai sempit gula dari Enterobacter sp. Ini tidakmengungkapkan kapsul atau mencairkan gelatin. Semua strain H. alvei segaris olehfag tunggal (yang tidak mempengaruhi Enterobacteraciae). Ada banyak serotipe.
Patogenesis: Strain mungkin diisolasi dari kotoran manusia dan hewan lainnya.Mereka juga dapat ditemukan dalam limbah, air tanah, dan produk susu. Ini adalahbug lingkungan, sebagian besar. Beberapa strain membawa gen pengkodeankemampuan untuk menyebabkan "melampirkan dan menonjolkan" lesi sel usus,mirip dengan EPEC (enteropathic E. coli). Ini basil Gram-negatif enterik danorofaringeal biasanya non-patogen. Hal ini assocaited dengan penyakit yang mendasari kronis (dan mungkin terjadi pada isolat pasien diintubasi endotracheally'), dan dapat menjadi penyebab pneumonia pada pengaturan masyarakat atau rumah sakit. Isolat biasanya menampilkan resistensi terhadap antibiotikkonvensional, termasuk penisilin sefalosporin, dan. Meskipun jarang, H. alveimungkin patogen potensial pada pasien dengan penyakit yang mendasari kronis
Patogenesis: Strain mungkin diisolasi dari kotoran manusia dan hewan lainnya.Mereka juga dapat ditemukan dalam limbah, air tanah, dan produk susu. Ini adalahbug lingkungan, sebagian besar. Beberapa strain membawa gen pengkodeankemampuan untuk menyebabkan "melampirkan dan menonjolkan" lesi sel usus,mirip dengan EPEC (enteropathic E. coli). Ini basil Gram-negatif enterik danorofaringeal biasanya non-patogen. Hal ini assocaited dengan penyakit yang mendasari kronis (dan mungkin terjadi pada isolat pasien diintubasi endotracheally'), dan dapat menjadi penyebab pneumonia pada pengaturan masyarakat atau rumah sakit. Isolat biasanya menampilkan resistensi terhadap antibiotikkonvensional, termasuk penisilin sefalosporin, dan. Meskipun jarang, H. alveimungkin patogen potensial pada pasien dengan penyakit yang mendasari kronis
p.mirabilis kelompok 21
Proteus mirabilis pertama kali ditemukan oleh seorang ahli patologi Jerman bernama Gustav Hauser (Williams dan Schwarzhoff, 1978). Hauser bernama ini Proteus genus, setelah karakter dalam itu Homer The Odyssey yang bagus untuk mengubah bentuk dan menghindari yang dipertanyakan (Williams dan Schwarzhoff, 1978), nama yang tampaknya apt diberikan kemampuan luar biasa ini organisme untuk menghindari sistem kekebalan inang. P. mirabilis adalah gram negatif, berbentuk batang bakteri yang dapat ditemukan sebagai bagian dari flora mikro di usus manusia. Organisme ini biasanya tidak patogen, tetapi tidak menjadi masalah ketika datang ke dalam kontak dengan urea di saluran kemih. Dari sana, infeksi dapat menyebar ke bagian lain dari tubuh. Ini adalah salah satu spesies genus Proteus dalam bertanggung jawab untuk menyebabkan infeksi saluran kemih pada ribuan orang setiap tahun di rumah sakit. P. mirabilis account untuk sebagian besar infeksi saluran kemih yang terjadi dalam pengaturan rumah sakit dan selama sembilan puluh persen dari infeksi Proteus (Gonzalez, 2006). Its genom kode untuk setidaknya 10 faktor adhesi membuat organisme ini sangat lengket dan motil. P. mirabilis tes indole positif dan dapat dengan mudah diidentifikasi dalam piring agar darah oleh pembentukan cincin konsentris gerakannya mengerumuni (Lund et al., 1975).
Infeksi saluran kemih (UTI) sangat menyakitkan dan bisa menjadi mematikan jika infeksi menyebar ke sistem lain dalam tubuh. Setelah pneumonia, infeksi saluran kemih adalah masalah yang paling umum dalam jangka panjang pasien rumah sakit. Infeksi ini menjadi lebih sulit untuk mengobati karena empat puluh delapan persen dari strain P. mirabilis resisten terhadap fluoroquinolones amoksisilin, penisilin, dan luas jangkauan aktivitas antibiotik.
PH urine biasanya netral atau sedikit asam, tetapi ketika pasien memakai kateter untuk jangka waktu deposito kristal dari urine membentuk kerak sekitar kateter urin dan menghambat dari bergerak melalui uretra. Bertatahkan kristal pada kateter P. mirabilis memberikan kesempatan untuk menjajah dalam jumlah besar dan untuk menghidrolisis urea, sehingga meningkatkan pH lingkungan melalui produksi atau amonia (Stickler et al., 2004).
Struktur Genom
Urutan genom P. mirabilis selesai 28 Maret 2008 oleh Melanie M. Pearson mengidentifikasi lebih dari 3.658 urutan coding dengan 7 lokus rRNA (Pearson et al, 2008.). Total panjang Genom adalah 4,063 Mb dengan kandungan GC 28,8%.P. mirabilis juga membawa plasmid tunggal dengan 36, 298 nukleotida. Plasmid itu sendiri tidak mengandung gen virulensi tetapi mungkin mengandung bakteriosin dan sistem kekebalan nya. Dalam genom adalah pulau genomik terlibat dalam patogenisitas yang kode untuk sebuah sistem sekresi tipe III yang terdiri dari 24 gen yang digunakan untuk menyuntikkan protein bakteri ke dalam genom inang. Sistem tipe III tampaknya akan dimasukkan melalui transfer gen horizontal dan dicatat untuk G yang relatif kecil + C konten dibandingkan dengan sisa genom (Pearson et al., 2008). Urutan genom encode 17 jenis yang berbeda dari fimbriae serta 54 kb regulon flagellar. Flagela dibuat oleh strain semua berasal dari lokus tunggal.Informasi ini ditandai untuk strain uropathogenic tertentu dari P. mirabilis, HI4320. Ini adalah urutan diselesaikan terlebih dahulu dari bakteri dari lebih dari 75 strain diketahui yang diidentifikasi dengan menggunakan salah satu dimensi SDS HALAMAN protein seluler sebagian besar berasal dari asal manusia (Holmes dkk., 2008).
Struktur sel dan metabolisme
P. mirabilis memiliki morfologi bacillus dan merupakan bakteri gram-negatif. Hal ini motil, bergantian antara perenang vegetatif dan hiper-flagellated swarmer sel (Belas, 1996). Hal ini juga membuat berbagai fimbriae. Para endotoksin membran LPS yang mendapatkan respon inflamasi dari tuan rumah. (Gonzales, 2006).
P. mirabilis menghasilkan urease, sebuah enzim yang mengubah urea menjadi amonia dengan proses berikut: (NH2) 2CO -> 2NH3 + CO2. Infeksi oleh P. mirabilis sehingga dapat dideteksi oleh sampel urin basa (pH 8 dan ke atas) dengan jumlah besar amonia.
Ekologi
P. mirabilis dapat ditemukan sebagai mikroba hidup bebas dalam tanah dan air.Organisme ini juga biasanya ditemukan di saluran pencernaan manusia (Coker dkk., 2000). Beberapa percaya bahwa P. mirabilis memiliki akses ke kandung kemih dengan menginfeksi area periuretra (Coker dkk., 2000). P. mirabilis menyebabkan infeksi saluran kemih terutama melalui kateter. Biasanya saluran kemih dapat membersihkan mikroba sebelum terakumulasi, tetapi kateter mencegah hal ini terjadi. P. mirabilis kemudian dapat mematuhi bagian dalam dan helai kertas yg luar dari kateter, membentuk komunitas biofilm. Setelah didirikan, mikroba ini melewati uretra melalui berkerumun motilitas ke kandung kemih. P. mirabilis mengikat sel-sel epitel kandung kemih di mana akhirnya berkolonisasi (Coker dkk., 2000). P. mirabilis infeksi juga dapat menyebabkan produksi batu ginjal dan kandung kemih. Bakteri menjajah batu sebagai mereka membentuk, membuat mereka kurang dapat diakses untuk menyerang antibiotik (Pearson et al., 2008).
Infeksi saluran kemih (UTI) sangat menyakitkan dan bisa menjadi mematikan jika infeksi menyebar ke sistem lain dalam tubuh. Setelah pneumonia, infeksi saluran kemih adalah masalah yang paling umum dalam jangka panjang pasien rumah sakit. Infeksi ini menjadi lebih sulit untuk mengobati karena empat puluh delapan persen dari strain P. mirabilis resisten terhadap fluoroquinolones amoksisilin, penisilin, dan luas jangkauan aktivitas antibiotik.
PH urine biasanya netral atau sedikit asam, tetapi ketika pasien memakai kateter untuk jangka waktu deposito kristal dari urine membentuk kerak sekitar kateter urin dan menghambat dari bergerak melalui uretra. Bertatahkan kristal pada kateter P. mirabilis memberikan kesempatan untuk menjajah dalam jumlah besar dan untuk menghidrolisis urea, sehingga meningkatkan pH lingkungan melalui produksi atau amonia (Stickler et al., 2004).
Struktur Genom
Urutan genom P. mirabilis selesai 28 Maret 2008 oleh Melanie M. Pearson mengidentifikasi lebih dari 3.658 urutan coding dengan 7 lokus rRNA (Pearson et al, 2008.). Total panjang Genom adalah 4,063 Mb dengan kandungan GC 28,8%.P. mirabilis juga membawa plasmid tunggal dengan 36, 298 nukleotida. Plasmid itu sendiri tidak mengandung gen virulensi tetapi mungkin mengandung bakteriosin dan sistem kekebalan nya. Dalam genom adalah pulau genomik terlibat dalam patogenisitas yang kode untuk sebuah sistem sekresi tipe III yang terdiri dari 24 gen yang digunakan untuk menyuntikkan protein bakteri ke dalam genom inang. Sistem tipe III tampaknya akan dimasukkan melalui transfer gen horizontal dan dicatat untuk G yang relatif kecil + C konten dibandingkan dengan sisa genom (Pearson et al., 2008). Urutan genom encode 17 jenis yang berbeda dari fimbriae serta 54 kb regulon flagellar. Flagela dibuat oleh strain semua berasal dari lokus tunggal.Informasi ini ditandai untuk strain uropathogenic tertentu dari P. mirabilis, HI4320. Ini adalah urutan diselesaikan terlebih dahulu dari bakteri dari lebih dari 75 strain diketahui yang diidentifikasi dengan menggunakan salah satu dimensi SDS HALAMAN protein seluler sebagian besar berasal dari asal manusia (Holmes dkk., 2008).
Struktur sel dan metabolisme
P. mirabilis memiliki morfologi bacillus dan merupakan bakteri gram-negatif. Hal ini motil, bergantian antara perenang vegetatif dan hiper-flagellated swarmer sel (Belas, 1996). Hal ini juga membuat berbagai fimbriae. Para endotoksin membran LPS yang mendapatkan respon inflamasi dari tuan rumah. (Gonzales, 2006).
P. mirabilis menghasilkan urease, sebuah enzim yang mengubah urea menjadi amonia dengan proses berikut: (NH2) 2CO -> 2NH3 + CO2. Infeksi oleh P. mirabilis sehingga dapat dideteksi oleh sampel urin basa (pH 8 dan ke atas) dengan jumlah besar amonia.
Ekologi
P. mirabilis dapat ditemukan sebagai mikroba hidup bebas dalam tanah dan air.Organisme ini juga biasanya ditemukan di saluran pencernaan manusia (Coker dkk., 2000). Beberapa percaya bahwa P. mirabilis memiliki akses ke kandung kemih dengan menginfeksi area periuretra (Coker dkk., 2000). P. mirabilis menyebabkan infeksi saluran kemih terutama melalui kateter. Biasanya saluran kemih dapat membersihkan mikroba sebelum terakumulasi, tetapi kateter mencegah hal ini terjadi. P. mirabilis kemudian dapat mematuhi bagian dalam dan helai kertas yg luar dari kateter, membentuk komunitas biofilm. Setelah didirikan, mikroba ini melewati uretra melalui berkerumun motilitas ke kandung kemih. P. mirabilis mengikat sel-sel epitel kandung kemih di mana akhirnya berkolonisasi (Coker dkk., 2000). P. mirabilis infeksi juga dapat menyebabkan produksi batu ginjal dan kandung kemih. Bakteri menjajah batu sebagai mereka membentuk, membuat mereka kurang dapat diakses untuk menyerang antibiotik (Pearson et al., 2008).
| Kingdom: | |
| Phylum: | |
| Class: | Gamma Proteobacteria |
| Order: | |
| Family: | |
| Genus: | |
| Species: | P. mirabilis |
Pseudomonas sp kelompok 23
| Kerajaan: | |
| Filum: | |
| Kelas: | |
| Ordo: | |
| Famili: | |
| Genus: | Pseudomonas Migula 1894 |
Bakteri Pseudomonas dapat ditemukan di berbagai lingkungan seperti tanah, air tanaman, dan dan jaringan hewan. Banyak spesies yang berbeda dari bakteri patogen oportunistik yang mempengaruhi manusia, hewan, dan tanaman.Pseudomonas aeruginosa, yang disebut "lambang" patogen oportunistik, hampir tidak pernah menginfeksi jaringan tanpa kompromi, namun, dapat menginfeksi hampir semua jenis jaringan jika jaringan yang memiliki beberapa jenis pertahanan dikompromikan (Todar).
Struktur Genom
Pseudomonas syringae pathovar DC3000 tomat, tomat dan patogen Arabidopsis thaliana, memiliki genom 6,5 megabases dalam ukuran yang dikompromikan dari sebuah kromosom melingkar dan dua plasmid, yang semua encode untuk 5.763 ORFs. 298 didirikan dan gen virulensi diduga ditemukan termasuk yang menyandikan untuk comfirmed 31 dan 19 diperkirakan protein berhadapan dengan sistem sekresi. Banyak dari gen virulensi yang proksimal unsur bergerak; ini secara kolektif membentuk 7% dari seluruh genom. Genom juga memiliki banyak gen yang terlibat dengan gerakan nutrisi, terutama gula, serta gen berurusan dengan lampiran sel ke permukaan tanaman. Lebih dari 12% dari gen yang ditemukan untuk berurusan dengan peraturan, ini mungkin karena kebutuhan bakteri "untuk adaptasi cepat terhadap lingkungan yang beragam yang dihadapi selama pertumbuhan epifit dan patogenesis" (Buell et al 2003.). Sementara banyak kesamaan yang ditemukan antara genom Pseudomonas syringae pathovar tomat DC3000, Pseudomonas putida, dan Pseudomonas aeruginosa, 1.159 gen yang ditemukan untuk menjadi unik untuk DC3000, 811 yang tidak memiliki fungsi yang diketahui. (Buell et al. 2003)
Struktur sel dan Metabolisme
Pseudomonas fluorescens. Perhatikan beberapa flagela yang memberikan motilitas sel. Dari DOE Joint Genome Institute.
Bakteri Pseudomonas umumnya aerobik berbentuk batang bakteri yang dikenal karena keragaman metabolisme mereka (DOE Joint Genome Institute). Beberapa spesies bakteri ini, seperti P. aeruginosa, adalah patogen oportunistik yang mengeluarkan protease ekstraseluler dan mematuhi dan menginvasi jaringan host.Lebih dari setengah dari isolat klinis bakteri Pseudomonas menghasilkan pyocyanin, pigmen biru-hijau. Pseudomonas fluorescens kelompok nonpathogenic saprophytes yang juga memproduksi pigmen, terutama dalam kondisi ketersediaan zat besi rendah. Pigmen ini adalah, larut kehijauan, pigmen fluorescent yang menyebabkan nama kelompok. Bakteri aerob obligat umumnya, namun, beberapa strain dapat memanfaatkan NO3 bukan O2 sebagai akseptor elektron. Mereka memiliki beberapa kutub flagela yang membantu dalam gerakan bakteri. Karena mereka memiliki persyaratan gizi sederhana, mereka "tumbuh baik dalam media garam mineral ditambah dengan salah satu dari sejumlah besar sumber karbon" (DOE). Beberapa penelitian berusaha untuk mengeksploitasi P. fluorescens untuk menurunkan polutan sebagian atau seluruhnya seperti stirena, TNT, dan hidrokarbon polisiklik aromatik. Beberapa strain dari bakteri juga memiliki kemampuan untuk menekan penyakit tanaman dengan "melindungi benih dan akar dari infeksi jamur" (DOE). Kemampuan ini disebabkan metabolit sekunder yang dihasilkan oleh bakteri ini seperti antibiotik, siderophores, dan hidrogen sianida serta kemampuan bakteri ini untuk secara cepat menjajah rizosfer dan bersaing di luar beberapa patogen (DOE).
Ekologi
Bakteri Pseudomonas dapat ditemukan di tanah, rawa, habitat laut pesisir, dan pabrik dan jaringan hewan, umumnya, bakteri ini bisa mentolerir berbagai kondisi fisik. Beberapa spesies, seperti Pseudomonas aeruginosa, adalah patogen oportunistik. Pasien cystic fibrosis, membakar korban, orang-orang dengan kanker, dan pasien yang berada di unit perawatan intensif untuk waktu yang lama adalah yang paling berisiko untuk tertular penyakit yang disebabkan oleh infeksi P. aeruginosa (Pseudomonas Gemone Proyek).
Spesies Pseudomonas juga bertanggung jawab atas pembusukan susu bahkan setelah proses pasteuriztion. Menjadi psyrotropic bakteri, bakteri ini dapat tumbuh dan berkembang biak di dalam kulkas menyebabkan penurunan yang besar dalam kehidupan rak produk susu. Dalam rangka untuk memeriksa pembusukan produk susu dari bakteri, Dogan dan Boot terisolasi 338 spesies yang berbeda dari Pseudomonas dari susu mentah, susu olahan, dan lingkungan. Kategorisasi dari spesies yang berbeda dari Pseudomonas tidak dilakukan dengan menggunakan metode tradisional seperti "pengamatan pola pertumbuhan pada media selektif dan differentiative, reaksi biokimia, dan mikroskop." Namun, metode genotipik seperti ribotyping digunakan. Metode ini "menawarkan peningkatan daya diskriminatif Ribotyping telah terbukti cepat dan reproducibly jenis isolat bakteri untuk genus, spesies, dan tingkat ketegangan.." Dogan dan Boot menemukan 42 pola ribotype berbeda dalam 81 isolat mereka diuji. Hal ini menunjukkan keragaman besar spesies Pseudomonas hadir diantara produk susu. Keanekaragaman bertanggung jawab atas pola yang berbeda dari memanjakan terlihat dalam susu. (Dogan dan Boot)
Selanjutnya, mereka menemukan bahwa cacat rasa susu olahan dikaitkan dengan kedua angka tinggi Pseudomonas dan adanya enzim degradatif seperti lipase, lecithinase, dan protease ekstraseluler. Organisme dengan ribotypes serupa ditemukan memiliki aktivitas enzimatik yang sama. Hal ini menunjukkan hubungan antara ribotypes bakteri dan kemampuan mereka untuk merusak. Jadi ribotyping adalah metode yang nyaman dan dapat diandalkan untuk mengidentifikasi strain dengan potensi pembusukan makanan. (Dogan dan Boot)
Struktur Genom
Pseudomonas syringae pathovar DC3000 tomat, tomat dan patogen Arabidopsis thaliana, memiliki genom 6,5 megabases dalam ukuran yang dikompromikan dari sebuah kromosom melingkar dan dua plasmid, yang semua encode untuk 5.763 ORFs. 298 didirikan dan gen virulensi diduga ditemukan termasuk yang menyandikan untuk comfirmed 31 dan 19 diperkirakan protein berhadapan dengan sistem sekresi. Banyak dari gen virulensi yang proksimal unsur bergerak; ini secara kolektif membentuk 7% dari seluruh genom. Genom juga memiliki banyak gen yang terlibat dengan gerakan nutrisi, terutama gula, serta gen berurusan dengan lampiran sel ke permukaan tanaman. Lebih dari 12% dari gen yang ditemukan untuk berurusan dengan peraturan, ini mungkin karena kebutuhan bakteri "untuk adaptasi cepat terhadap lingkungan yang beragam yang dihadapi selama pertumbuhan epifit dan patogenesis" (Buell et al 2003.). Sementara banyak kesamaan yang ditemukan antara genom Pseudomonas syringae pathovar tomat DC3000, Pseudomonas putida, dan Pseudomonas aeruginosa, 1.159 gen yang ditemukan untuk menjadi unik untuk DC3000, 811 yang tidak memiliki fungsi yang diketahui. (Buell et al. 2003)
Struktur sel dan Metabolisme
Pseudomonas fluorescens. Perhatikan beberapa flagela yang memberikan motilitas sel. Dari DOE Joint Genome Institute.
Bakteri Pseudomonas umumnya aerobik berbentuk batang bakteri yang dikenal karena keragaman metabolisme mereka (DOE Joint Genome Institute). Beberapa spesies bakteri ini, seperti P. aeruginosa, adalah patogen oportunistik yang mengeluarkan protease ekstraseluler dan mematuhi dan menginvasi jaringan host.Lebih dari setengah dari isolat klinis bakteri Pseudomonas menghasilkan pyocyanin, pigmen biru-hijau. Pseudomonas fluorescens kelompok nonpathogenic saprophytes yang juga memproduksi pigmen, terutama dalam kondisi ketersediaan zat besi rendah. Pigmen ini adalah, larut kehijauan, pigmen fluorescent yang menyebabkan nama kelompok. Bakteri aerob obligat umumnya, namun, beberapa strain dapat memanfaatkan NO3 bukan O2 sebagai akseptor elektron. Mereka memiliki beberapa kutub flagela yang membantu dalam gerakan bakteri. Karena mereka memiliki persyaratan gizi sederhana, mereka "tumbuh baik dalam media garam mineral ditambah dengan salah satu dari sejumlah besar sumber karbon" (DOE). Beberapa penelitian berusaha untuk mengeksploitasi P. fluorescens untuk menurunkan polutan sebagian atau seluruhnya seperti stirena, TNT, dan hidrokarbon polisiklik aromatik. Beberapa strain dari bakteri juga memiliki kemampuan untuk menekan penyakit tanaman dengan "melindungi benih dan akar dari infeksi jamur" (DOE). Kemampuan ini disebabkan metabolit sekunder yang dihasilkan oleh bakteri ini seperti antibiotik, siderophores, dan hidrogen sianida serta kemampuan bakteri ini untuk secara cepat menjajah rizosfer dan bersaing di luar beberapa patogen (DOE).
Ekologi
Bakteri Pseudomonas dapat ditemukan di tanah, rawa, habitat laut pesisir, dan pabrik dan jaringan hewan, umumnya, bakteri ini bisa mentolerir berbagai kondisi fisik. Beberapa spesies, seperti Pseudomonas aeruginosa, adalah patogen oportunistik. Pasien cystic fibrosis, membakar korban, orang-orang dengan kanker, dan pasien yang berada di unit perawatan intensif untuk waktu yang lama adalah yang paling berisiko untuk tertular penyakit yang disebabkan oleh infeksi P. aeruginosa (Pseudomonas Gemone Proyek).
Spesies Pseudomonas juga bertanggung jawab atas pembusukan susu bahkan setelah proses pasteuriztion. Menjadi psyrotropic bakteri, bakteri ini dapat tumbuh dan berkembang biak di dalam kulkas menyebabkan penurunan yang besar dalam kehidupan rak produk susu. Dalam rangka untuk memeriksa pembusukan produk susu dari bakteri, Dogan dan Boot terisolasi 338 spesies yang berbeda dari Pseudomonas dari susu mentah, susu olahan, dan lingkungan. Kategorisasi dari spesies yang berbeda dari Pseudomonas tidak dilakukan dengan menggunakan metode tradisional seperti "pengamatan pola pertumbuhan pada media selektif dan differentiative, reaksi biokimia, dan mikroskop." Namun, metode genotipik seperti ribotyping digunakan. Metode ini "menawarkan peningkatan daya diskriminatif Ribotyping telah terbukti cepat dan reproducibly jenis isolat bakteri untuk genus, spesies, dan tingkat ketegangan.." Dogan dan Boot menemukan 42 pola ribotype berbeda dalam 81 isolat mereka diuji. Hal ini menunjukkan keragaman besar spesies Pseudomonas hadir diantara produk susu. Keanekaragaman bertanggung jawab atas pola yang berbeda dari memanjakan terlihat dalam susu. (Dogan dan Boot)
Selanjutnya, mereka menemukan bahwa cacat rasa susu olahan dikaitkan dengan kedua angka tinggi Pseudomonas dan adanya enzim degradatif seperti lipase, lecithinase, dan protease ekstraseluler. Organisme dengan ribotypes serupa ditemukan memiliki aktivitas enzimatik yang sama. Hal ini menunjukkan hubungan antara ribotypes bakteri dan kemampuan mereka untuk merusak. Jadi ribotyping adalah metode yang nyaman dan dapat diandalkan untuk mengidentifikasi strain dengan potensi pembusukan makanan. (Dogan dan Boot)
Salmonella sp. Kelompok 1&24
Sementara genus Salmonella terdiri dari dua spesies, S. dan S. enterica bongori, keanekaragaman terletak pada 2.000 serovarian atas yang terdiri dari S. enterica.Sebuah contoh dari serovar adalah S. typhi, yang menyebabkan infeksi sistemik dan demam tifoid, namun sangat host tertentu dan hanya akan menginfeksi manusia, membunuh 500.000 diperkirakan per tahun di seluruh dunia. Ini telah diamati untuk menginfeksi jaringan yang lebih dalam daripada banyak serovarian S. enterica seperti hati, limpa, dan sumsum tulang. Di sisi lain dari spektrum, S. typhimurium menyebabkan gastroenteritis dan dapat menginfeksi spesies mamalia banyak. Studi genom Salmonella, terutama S. typhi, mungkin memberikan wawasan yang mungkin target untuk obat untuk menyerang untuk membantu menyembuhkan penyakit (tifus) dan untuk vaksinasi.
Struktur Genom
Salmonella typhi CT18 memiliki kromosom melingkar besar yang terdiri dari 4,8 Mb dan dua plasmid, pHCM1 dan pHCM2, yang 218 kb dan 106 kb masing-masing.PHCM2 plasmid erat terkait dengan pMT1 plasmid dari Yersinia pestis, tetapi tidak memiliki operon antigen kapsuler dan gen racun tikus yang merupakan ciri khas pMT1. Vaksin ini dikembangkan menggunakan Ty2 S. typhi, yang terdiri dari satu kromosom besar yang 4,7 Mb. Hal ini tidak terkait dengan plasmid yang memiliki band beberapa obat tahan seperti regangan CT18. S. typhimurium adalah kromosom melingkar 4,8 Mb panjang dengan pSLT kb 90 plasmid.
S. typhi memiliki 204 pseudogen CT18, sembilan gen yang utuh dalam regangan Ty2. Seiring dengan 195 pseudogen kesamaan dengan CT18, saring Ty2 juga memiliki 11 yang unik. Discrepencies ditemukan lebih banyak ketika melihat prophages. Empat prophages terletak di bagian identik dari genom relatif terhadap gen nonphage berdekatan, dan kedua strain mengandung bagian prophages yang unik satu sama lain. Bahkan dengan perbedaan-perbedaan, genom dari dua strain lebih dari 98% sama, dan, tidak seperti Y. pestis strain KIM dan CO92, organisasi dari dua genom sangat mirip.
Struktur sel dan Metabolisme
Bakteri Salmonella adalah bakteri berbentuk batang motil yang memiliki flagela.
Ekologi
Bakteri salmonella yang sangat umum pada kulit telur mentah, unggas, dan daging merah, juga merupakan bagian alami dari flora bakteri reptil dan amfibi. Untungnya, penanganan makanan yang tepat, memasak, dan membersihkan membunuh Salmonella, masih, mungkin dapat ditemukan di dapur kebanyakan. Selain habitat umum dari Salmonella, air yang tercemar merupakan salah satu sumber utama dari seluruh dunia kontraksi Salmonella.
Struktur Genom
Salmonella typhi CT18 memiliki kromosom melingkar besar yang terdiri dari 4,8 Mb dan dua plasmid, pHCM1 dan pHCM2, yang 218 kb dan 106 kb masing-masing.PHCM2 plasmid erat terkait dengan pMT1 plasmid dari Yersinia pestis, tetapi tidak memiliki operon antigen kapsuler dan gen racun tikus yang merupakan ciri khas pMT1. Vaksin ini dikembangkan menggunakan Ty2 S. typhi, yang terdiri dari satu kromosom besar yang 4,7 Mb. Hal ini tidak terkait dengan plasmid yang memiliki band beberapa obat tahan seperti regangan CT18. S. typhimurium adalah kromosom melingkar 4,8 Mb panjang dengan pSLT kb 90 plasmid.
S. typhi memiliki 204 pseudogen CT18, sembilan gen yang utuh dalam regangan Ty2. Seiring dengan 195 pseudogen kesamaan dengan CT18, saring Ty2 juga memiliki 11 yang unik. Discrepencies ditemukan lebih banyak ketika melihat prophages. Empat prophages terletak di bagian identik dari genom relatif terhadap gen nonphage berdekatan, dan kedua strain mengandung bagian prophages yang unik satu sama lain. Bahkan dengan perbedaan-perbedaan, genom dari dua strain lebih dari 98% sama, dan, tidak seperti Y. pestis strain KIM dan CO92, organisasi dari dua genom sangat mirip.
Struktur sel dan Metabolisme
Bakteri Salmonella adalah bakteri berbentuk batang motil yang memiliki flagela.
Ekologi
Bakteri salmonella yang sangat umum pada kulit telur mentah, unggas, dan daging merah, juga merupakan bagian alami dari flora bakteri reptil dan amfibi. Untungnya, penanganan makanan yang tepat, memasak, dan membersihkan membunuh Salmonella, masih, mungkin dapat ditemukan di dapur kebanyakan. Selain habitat umum dari Salmonella, air yang tercemar merupakan salah satu sumber utama dari seluruh dunia kontraksi Salmonella.
| Kerajaan: | |
| Filum: | |
| Kelas: | Gamma Proteobakteria |
| Ordo: | |
| Famili: | |
| Genus: | Salmonella Lignieres 1900 |
Scientific name: - Alcaligenes metaligeenes
Alcaligenes adalah genus dari Gram-negatif, patogen, bakteri oportunistik. Karena spesies dari genus ini sering salah diidentifikasi, masalah terkait dengan fibrosis kistik sulit untuk belajar dan memperbaiki. Isolat dari genus ini telah ditemukan di tanah atau air. Alcaligenes metaligenes sangat penting karena mengubahbentuk yang paling beracun arsenik, arsenite (AsO2-, bilangan oksidasi +3) untuk membentuk yang kurang berbahaya, arsenat (AsO4-, bilangan oksidasi +5).
Tidak ada komentar:
Posting Komentar